What's your favorite Japanese noodle dish?

日本の麺料理で一番好きなものは何ですか?

 

favorite は、

1番好きなもの、という意味

だから具体的な情報をつけて聞く

答えは一つの想定だから、isを使う

What's your favorite food?

だと、子供っぽい

 

What sport do you like the best?

What anime do you like the most?

でもOK